【科教在线】第53期：计算机与信息安全学院樊永显教授课题组在生物信息学顶刊发表研究论文（图）

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近日，计算机与信息安全学院樊永显教授课题组在生物信息学领域国际顶级期刊《Briefings in Bioinformatics》（JCR Q1区，中科院 Mathematical & Computational biology小类一区TOP，IF=9.5）上发表了题为 “EGPDI: identifying Protein-DNA binding sites based on multi-view graph embedding fusion“ 的研究论文，由郑梦鑫（第一作者）、孙贵聪、李雪萍共同完成，樊永显教授为通讯作者，乐动网页版为该论文的唯一署名单位。

蛋白质-DNA相互作用的机制涉及广泛的生物活动和过程，准确识别蛋白质和DNA之间的结合位点对分析遗传物质、探索蛋白质功能以及设计新型药物至关重要。该论文提出了一种基于多视图图嵌入融合的新型计算方法EGPDI，通过结合等变图神经网络和图卷积网络，优化了全局和局部节点嵌入表示。采用门控多头注意力机制更精准地捕捉关键信息，额外引入的蛋白质语言大模型，进一步丰富了其表示学习能力。独立测试和案例分析均验证了该模型的优越性和泛化能力。

该计算模型的潜在应用广泛，可用于开发更精确的个性化药物治疗方案，通过针对特定蛋白质-DNA相互作用的抑制剂来治疗遗传病和癌症。在基础生物学研究中，此模型能够提供对蛋白质功能和基因调控机制更深入的理解，从而推动生命科学的研究进展。